1、序列分析

　　系统发育推论

　　型号选择

　　约会和时钟

　　祖传国家

　　选择和测试

　　序列比对

　　2、统计方法

　　最大似然

　　距离方法

　　普通最小二乘

　　最大的简约

　　复合似然

　　贝叶斯

　　3、强大的视觉工具

　　对齐/跟踪编辑器

　　树探索者

　　数据探索者

　　传奇发电机

　　基因复制向导

　　时间树向导

　　1、我们下载该软件，安装exe文件

　　2、选择软件安装位置，软件默认安装在C盘中，建议更改安装位置在D盘中

　　3、按步骤选择相关信息，选择好之后点击Next

　　4、接着我们就可以看到软件正在安装中，耐心等待软件安装

　　5、软件安装完毕，点击finsh结束安装

　　如何用MEGA7.0转化为MEGA7.0可以用的格式？

　　物信息学实验有时候会要求做一些进化树图，但是我们所得到的序列一般都是FASTA格式，如何将FASTA格式转化成MEGA可以使用的格式呢。

　　1、打开MEGA7.0软件，熟悉MEGA7.0的版面

　　2、看到左上角的【Align】点击选择【Edit/Build Alignment】接下来会出现一个小窗口，点击【OK】

　　3、点击完【OK】又会弹出另一个小窗口，需要选择protein 或者DNA，看自己需要，这里演示先选择protein点击之后出现窗口，之后操作在新窗口中进行。

　　4、按图中箭头指示点击【Edit】再选择【Insert  Sequence From File Ctrl+I】点击之后在文件夹中选择自己要改变的FASTA格式序列，选定之后打开。

　　5、打开序列我们会看到如下的小窗口，接下来在左上角选择【Date】在子菜单中选择【Export Alignment】【MEGA Format】

　　6、对刚才打开的文件命名，选择存储位置，命名好之后点击【保存】出现一个小窗口输入和刚才一样的名字进去，点击【OK】就好了，文件格式已转换成功。