卷一·肺系病证方
一、感冒
二、咳嗽
三、中暑
四、时行瘟疫
五、伤寒
六、哮喘
七、肺痈、肺痨
卷二·心系病证方
一、心悸不寐
二、癫痫
三、厥证
卷三·脾胃病证方
一、反胃
二、噎嗝
三、呕吐、呃逆
四、胃痛
五、腹痛
六、泄泻
七、痢疾
八、霍乱
九、脾胃虚弱
卷四·肝胆病证方
一、黄疸
二、头痛
三、积聚
四、中风
五、肝胆杂病
卷五·肾系病证方
一、水肿
二、小便频数
三、小便不通
……
卷六·气血津液病证方
卷七·疟疾方
卷八·中毒病证方
卷九·各种风疾证方
卷十·肢体经络病证方
卷十一·痈疽发背方
卷十二·疮疡方
卷十三·瘰疬瘿瘤方
卷十四·肿毒方
卷十五·疝气方
卷十六·痔瘘方
卷十七·蛇虫咬伤方
卷十八·金镞竹木伤方
卷十九·跌打损伤方
卷二十·皮肤病证方
卷二十一·妇科病证方
卷二十二·儿科病证方
卷二十三·眼科病证方
卷二十四·耳科病证方
卷二十五·鼻科病证方
卷二十六·咽喉科病证方
卷二十七·口腔科病证方
卷二十八·濒湖药酒方
卷二十九·濒湖美容方
卷三十·濒湖养生方

李时珍原著的《濒湖集简方》出自《本草纲目》引据书目之中。所引医方皆在其下注明为“集简方”或“李时珍濒湖集简方”或“濒湖集简方”。《濒湖集简方》先于《本草纲目》而著成，是李时珍一生的临床经验所得，并将其作为《本草纲目》的重要参引文献，将《濒湖集简方》中所有医方大多数或作“附方”、或作“主治”说明药物功效；亦有少数医方化裁作“发明”或藏于“附录”之中。展现了李时珍当年临床经验的精髓，为后学者深入研究李时珍临床学术思想提供了又一部重要的医学文献。