此书收录的古籍为孔子博物馆所藏，并均入选《国家珍贵古籍》《山东省珍贵古籍名录》。在编排次序上，依据中国传统文献分类法，分为经、史、子、集四部分，每部分按照入选《珍贵古籍名录》的时间排序。每部古籍，一般选择图片1至5幅，以正文卷端为主，或其他反映本书特征的书影，如书名页、序跋等。这些珍贵的古籍体现了孔府藏书的丰富性，是研究经学、史学不可多得的资料，具有重要的文献和研究价值。

前言
凡例
经部
周易经傅集程朱解附绿纂注十四卷朱子易圆附绿纂注一卷朱子启蒙五赞附绿纂注一卷朱子筮儀附録纂注一卷朱子説易纲
領一卷
禮儀器制考釋不分卷
禮記注疏補缺一卷
大戴禮記補注十三卷序绿一卷
禨服释名一卷
列题事語分類考释一卷
埠雅二十卷
春秋公羊考釋一卷
界轩经脱十卷
樂律全書四十八卷
春秋三傅合篡十二卷
孔酸伯説经五稿三十七卷
乾隆御定石经
史部
大明世宗肅皇帝實録五百六十六卷
隋書八十五卷
孔氏實録十四卷
陋巷志八卷
史大紀二十六卷
歷代史纂左編一百四十二卷
讀史漫録十四卷
新刊官板批評正百将傅十卷續百将傅四卷
南監本三國志六十五卷
東萊先生三國志詳節二十卷
子部
皇朝仕學規範四十卷
二程先生粹言九卷
讀書札記一卷
數學九章十卷
新刊音點性理群書句解後集二十三卷
康節先生觀物篇解五卷…華夷花木鳥獸珍玩考十二卷
顔氏家訓二卷…
容齋随筆十六卷續筆十六卷三筆十六卷四筆十六卷五筆十卷
新編古今事文類聚前集六十卷後集五十卷續集二十八卷别集
三十二卷新集三十六卷外集十五卷
鹽邑志林四十種六十六卷附一種六卷
性理大全七十卷
申鑒五卷
管窥辑要八十卷
集部
御製避暑山莊詩二卷
司馬太師温國文正公傅家集八十卷目録二卷
安懷堂全集六卷…
朱文公校昌黎先生文集二十卷外集一卷遣文一卷傅一卷
范助卿文集六卷詩集二十一卷
詩譚十卷續録一卷
古文淵鑒六十四卷
明人詩纱正集十四卷續集十四卷
楚静章句十七卷…
分類補注李太白詩二十五卷年譜一卷
筠溪牧潜集七卷
鲁齋遗書十四卷
容臺文集十卷詩集四卷别集六卷
詩紀一百三十卷前集十卷附録一卷外集四卷别集十二卷
節孝先生文集三十卷語録一卷事實一卷本朝名臣言行録一卷皇朝東都事略卓行傅序一卷緒君子帖一卷
耕學齋詩集十卷
修吉堂文稿八卷道貴堂類稿二十一卷
御選唐宋詩醇四十七卷目绿二卷
述本堂詩集十八卷绩集五卷
詞纱十卷
三蘇先生文萃七十卷
宋名家詞九十卷
石湖居士詩集三十四卷
榕村詩選八卷首一卷
御定歴代题畫詩類一百二十卷