《日本所藏稀见明人别集汇刊》（第一辑）共收录日本内阁文库、蓬左文库藏稀见明人别集三十八种，大致以作者登科入仕时间为序，编为五十册。本书所收三十八种明人别集均为江户时期传入日本的珍稀文献。其中三十二种为海内外孤本；其他如俞大猷《正气堂集》、谢汝韶《天池先生存稿》、冯时可《冯玄岳金昌稿》、戴士琳《剡山堂稿》、陆卿子《玄芝集》、郑经《东壁楼集》等六种，虽非孤本，但也是稀见文献，具有重要的版本价值。
从内容看，本编所收各集，基本均有序跋，其中多者十数篇，如《瓿余》共十九序；其他如《南州草》共七序，《缪丁阳诗文集》五序。这些序跋，或叙作者生平，或叙编集刊行传播之况，或评文论诗，是研究明代文学史、书籍史、批评史的重要资料。其中部分序跋，或作者已无本集传世，孤篇仅见；或未见收于撰者本集，如徐梦华《奣尔楼遗稿》四卷，卷首序一《奣尔楼诗草叙》，屠隆撰，不见于屠氏今传《栖真馆集》等。这些都是明代文学文献的有益补充。
本编所收各明人别集，基本为明清时通过贸易传入日本，如冯时可《冯玄岳金昌稿》为宽永六年（一六二九）买本，缪一凤《缪丁阳诗文集》、沈鈇《浮湘集》为宽永七年（一六三〇）买本，苏濬《三余集》为宽永十年（一六三三）买本，谢汝韶《天池先生存稿》为宽永十三年（一六三六）买本。这些书籍购藏的信息，对研究中日文化交流也颇有意义。本编所收各集三十八种，共三十六位作者，从籍贯看，其中福建十三人、浙江七人、江苏四人、上海二人，山东、湖北、江西等各一人。虽然这些文献只是偶然的聚合，但却也真实反映了当时中日贸易中口岸在地物产和文化产品输出的优势。

本书所收三十八种明人别集中有三十二种为海内外孤本，其他六种虽非孤本，但也是稀见文献，具有重要的版本价值。
本编出版时，所收各书卷首均冠以解题，介绍书名、卷数、撰者、刊刻时间、册数等版本信息，以及图书内容、体例、特点、收藏情况、各目录著录情况等相关内容，供明代文学文化以及目录版本等研究之用，具有较高的学术资料价值。