健康医疗大数据管理以互联网+和大数据时代为背景，主要研究大数据分析理论和方法在医疗领域中的应用以及大数据管理与治理方法。是一门同时包含理论方法和工程技术知识的综合性专业课程。课程首先介绍了健康医疗大数据的概念、系统和存储，再介绍了如何进行分析和安全管理，最后介绍了大数据在药物研发、公共卫生监测、公众健康管理、卫生政策方面的应用。课程引导学生了解大数据管理的发展趋势，掌握相关的主要方法与技术，培养学生面对大数据背景下的复杂工程问题的分析和解决问题的能力。
教材共分为10个章节，分别为健康医疗大数据概述（包括健康医疗大数据的概念、健康医疗大数据的发展、健康医疗大数据的展望、新时代中国特色社会主义下的健康医疗大数据）、健康医疗大数据系统（包括健康医疗大数据系统建设基础、健康医疗大数据系统架构及组成、健康医疗大数据系统功能、健康医疗大数据系统关键技术、健康医疗大数据系统发展趋势）、健康医疗大数据存储（包括健康医疗大数据存储与管理方法、基于新型存储的健康医疗大数据管理、健康医疗大数据处理与存储一体化技术）、健康医疗大数据分析（包括传统的数据分析技术、健康医疗大数据的实时分析、健康医疗大数据的交互式分析、健康医疗大数据的智能分析）、健康医疗大数据安全管理（包括健康医疗大数据安全体系架构、健康医疗大数据安全管理平台、健康医疗大数据安全管理过程、健康医疗大数据安全运行维护）、大数据与临床诊疗管理与决策（包括健康效益度量、精准医疗辅助、诊疗过程优化）、大数据与药物研发（包括临床试验设计优化、辅助药物效用分析、药物不良反应监测、新药研发市场模拟）、大数据与公共卫生监测（包括传染病监测、非传染病监测、健康相关问题监测）、大数据与公众健康管理（包括慢病管理、远程医疗、疾病预测）、大数据与卫生政策（包括医疗服务供需分析、医疗资源配置优化、医疗保险统筹支付、医疗政策执行监管）。