中医病因学是一门研究致病因素的客观实在及其致病机制的中医基础性学科。
中医病因学参考西医学的研究成果，以中医形态学为理论依据，以西医学的疾病为线索，建立了中医病因与西医病因、中医病机与西医病理生理之间的映射关系，并根据传统病因的内涵及其引发的症状，将其进行了拆分和重组，建立了以病因、条件、流病、形病和神病为主干的理论框架。
本书启用了50个具有全新内涵的病因概念，明确了这些概念的客观实在和逻辑关系，给出了547种常见病、多发病和特发病的内涵和中医病因病机解释。

绪论
第一章 病因（factors）
第一节 淫气（pathogenic microorganisms）
一、病毒（virus）
二、细菌（bacterium）
三、支原体（mycoplasma）
四、衣原体（chlamydia）
五、螺旋体（spirochete）
六、立克次体（rickettsia）
七、放线菌（actinomycetes）
八、真菌（fungus）
第二节 尸虫（parasites）
一、原虫（protozoa）
二、蠕虫（helminth）
三、节肢动物（arthropod）
第三节 逆气（immunogens）
一、抗原（antigen）
二、超抗原（superantigen）
三、丝裂原（mitogen）
四、佐剂（adjavant）
第四节 外伤（injuries）
一、机械损伤（mechanical damage）
二、烧烫伤（bum）
三、冻伤（frostbite）
四、触电伤（electric shock）
五、气压伤（barotrauma）
六、辐射伤（radiation injury）
七、噪声伤（noise）
八、溺水伤（drowning）
第五节 医过（medical errors）
一、药毒（improper medication）
二、失术（technical defects）
第六节 杂毒（chemical toxins）
第七节 胎传（congenital factors）
第八节 异物（foreign matters）
第二章 条件（conditions）
第一节 个体因素（individual factors）
一、性别（sex factors）
二、年龄（age factors）
三、饮食（poor diets）
四、过劳（excessive fatigues）
五、过逸（excessive relaxations）
六、七情（bad emotions）
七、人格（personality disorders）
八、胎禀（genetic and congenital diseases）
……
第三章 流病（fluid diseases）
第四章 形病（organic diseases）
第五章 神病（functional diseases）
主要参考文献
中医工程学丛书