本书是作者第一本重要的著作，主要在晚明思想裂变的大背景下，讨论西学的传入与晚明学者的回应。作者认为，明代在王阳明以后心学流弊丛生，佛门衰颓，思想界呈“裂变”态势，如何落实道德实践成为一个最重要的难题。以晚明的这种现实问题为基本立足点，作者讨论了西学的传入过程、策略与基本内容以及相对应的晚明学者的回应，对西学之无法解决当时的问题作出了自己的解释，对晚明学者立足儒家立场所进行的道德实践探索作出了精到的分析。

引言1
第一章晚明思想的裂变1
第一节王阳明留下的任务2
第二节封域于意识的功夫展开7
第三节良知的内外落实与流产20
第四节佛门之衰颓、改造与失效37
第五节纠弹与问题43
第二章从世俗伦理到天主实义50
第一节目的与手段50
第二节论友道54
第三节斥佛合儒的原因73
第四节天主及其存在的论证77
第三章以耶易儒或以耶补儒97
第一节以耶易儒：不可能与不必要101
第二节以西政西，以中化中109
第三节云栖袾宏的斥耶115
第四节以耶补儒：科学的与教化的122
附：《辟略说条驳》的言说风格与身份意识145
第四章存于现世而面对后世的人163
第一节论灵魂164
第二节灵魂永恒的证明173
第三节人的位置190
第四节合目的与手段为一体的后世204
第五章为何破邪与如何破邪213
第一节南京教案214
第二节从行政禁抑到学理征伐226
第三节僧俗联手斥耶之自诠240
第四节全方位的破邪246
第五节破邪者的问题259
第六章《七克》：克性之谓道266
第一节《七克》的性质、文体及对儒家术语的袭用268
第二节服从上帝与后世报应278
第三节克性之谓道291
第四节改过与积善303
第七章《人谱》：成就人生之谱311
第一节回应邪说314
第二节性体及其展开321
第三节过错的产生及其分类329
第四节改过的方法342
结论350
参考文献353
后记361
再版后记365
索引366