《彩绘细菌世界历险记》主要内容包括科学童话：菌儿自传，科学小品：细菌与人，科学趣谈：细胞的不死精神。

科学童话：菌儿自传
我的名称
我的籍贯
我的家庭生活
无情的火
水国纪游
生计问题
呼吸道的探险
肺港之役
吃血的经验
乳峰的回顾
食道的占领
肠腔里的会议
清除腐物
土壤革命
经济关系
科学小品：细菌与人
人生七期
人身三流
色——谈色盲
声——爆竹声中话耳鼓
香——谈气味
味——说吃苦
触——清洁的标准
细菌的衣食住行
细菌的大菜馆
细菌的形态
细菌的祖宗——生物的三元论
清水和浊水
地球的繁荣与土壤的劳动者
细菌学的第一课
科学趣谈：细胞的不死精神
细胞的不死精神
纸的故事
漫谈粗粮和细粮
炼铁的故事
灰尘的旅行