本书以通行本《素问》81篇的主要内容分为养生、脏象、脉法、经络、孔穴、病论、治论、刺法、雷公问、运气十类、重予编次，并通过调整各篇文字将原散佚的《刺法论》和《本病论》二篇补齐，在原文各段之后均有扼要注释。其注释参考采摭王冰等历代《内经》注家之精论、间附作者本人对《素问》研究之心得。

素问悬解自序

新刻素问悬解序

卷一

 养生

上古天真论一

四气调神论二

金柜正言论三

生气通天论四 

阴阳应象论五 

卷二

 脏象

十二脏相使论六

五脏别论七

五脏生成论八

脏气法时论九

宣明五气十 

 脉法

经脉别论十

三部九侯论十二

平人气象论十三

脉要精微论十四

卷三

 脉法

生机正脏论十五

通评虚实论十六 

诊要经络论十七

玉板论要十八

阴阳别论十九 

大奇论二十

卷四  

 经络

阴阳离合论二十

血气形志二十二

太阴阳明论二十三

脉解二十四

阳明脉解二十五

皮部论二十六

经络论二十七

 孔穴

气穴论二十八

气府论二十九

水热穴论三十

骨孔论三十一

卷五

 病论

风论三十二

痹论三十三

痿论三十四

厥论三十五

咳论三十六

疟论三十七

热论三十八

评热病论三十九

卷六

 病论

举痛论四十

气厥论四十

逆调论四十二

腹中论四十三

病态论四十四

奇病论四十五

标本病传论四十六

本病论四十七

 治论

汤液醪醴论四十八

移精变气论四十九

异法方宜论五十

卷七

 刺法

宝命全形论五十

针解五十二

八正神明论五十三

离合正邪论五十四

四时刺逆顺论五十五

刺法论五十六

刺志论五十七

刺禁论五十八

刺要论五十九

刺齐论六十

长刺节论六十一

卷八  

 刺法

调经论六十二

缪刺论六十三

刺疟六十四

刺热六十五

刺腰痛六十六

卷九

 雷公问

阴阳类论六十七

著至教论六十八

示从容论六十九

疏五过论七十

徵四失论七十一

方盛衰论七十二

解精微论七十三

卷十

 运气

六节脏象论七十四

天元纪大论七十五

五运行大论七十六

六微旨大论七十七

卷十一

 运气

气交变大论七十八

五常政大论七十九

卷十二

 运气

至正要大论八十

卷十三

 运气 

六元正纪大论八十一

附录

校勘举例

“搏、搏”辨析

“匮”字辨析

“卒、猝”辨析

“令尖如挺”考议

“络却”穴名辨真

“跗阳”穴名辨真

《玉机真脏论》正名

“逢寒则虫，逢热则纵”辨

《内经》避讳字初探

《易经》与三阴三阳

易学八图

后记