由陈士铎编著的《石室秘录》内容介绍：今上戊辰二月花朝后三日，远公陈子，将岐天师《石室秘录》请序于余，余读之惊异，叹医道之神而奇也。夫医至起死奇矣，而兹编实不止此。其文肆而醇，其意深而旨，乃性天之学，非刀圭之书也。陈子学博天人，理通鬼神，人得此编之秘，何患医道之不入于化乎。

石室秘录·卷之一 礼集

 正医法

 反医法

 顺医法

 逆医法

 内治法

 外治法

 完治法

 碎治法

 大治法

 小治法

 偏治法

 全治法

 生治法

 死治法

石室秘录·卷之二 乐集

 上治法

 中治法

 下治法

 先治法

 后治法

 急治法

 缓治法

 本治法

 末治法

 不内外治法

 阴治法

 阳治法

 假治法

 真治法

 男治法

 女治法

 虚治法

 实治法

 寒治法

 热治法

 通治法

 塞治法

 解治法

 敛治法

 升治法

 堕治法

 开治法

 闭治法

 吐治法

 泄治法

石室秘录·卷之三 射集

 王治法

 霸治法

 倒治法

 缚治法

 肥治法

 瘦治法

 摩治法

 浴治法

 达治法

 发治法

 夺治法

 深治法

 浅治法

 长治法

 短治法

 日治法

 夜治法

 气治法

 血治法

 脏治法

 腑治法

 常治法

 变治法

 初治法

 终治法

 专治法

 分治法

 同治法

 异治法

 劳治法

 逸治法

 吸治法

 引治法

 单治法

 双治法

 立治法

 卧治法

 饥治法

 饱治法

石室秘录·卷之四 御集

 富治法

 贫治法

 产前治法

 产后治法

 老治法

 少治法

 东南治法

 西北治法

 皮毛治法

 肌肤治法

 筋脉治法

 温治法

 清治法

 收治法

 散治法

 软治法

 坚治法

 抑治法

 扬治法

 痰治法

 火治法

 静治法

 动治法

 春夏治法

 秋冬治法

 奇治法

 平治法

 奇治法

 偶治法

 形治法

 气治法

 暗治法

 明治法

石室秘录·卷之五 书集

 久治法

 暂治法

 远治法

 近治法

 轻治法

 重治法

 瘟疫治法

 瘴疠治法

 得治法

 失治法

 意治法

 神治法

 伤寒相舌秘法

 一论五行

 二论脏腑

 三论阴阳

 四论昼夜

 五论四时

 六论气色

 七论脉诀

 八论强弱

 九论寒热

 十论生死

 十一论真假

 十二论老少

 十三论气血

 十四论命门

 十五论任督

 十六论子嗣

 十七论瘟疫

 岐天师儿科治法

 诸真人传授儿科

 张真人传痘疹门

 钱真人传痘疮

 神方

 岐天师传治回

 毒方

 岐天师又传治回

 毒岁久不愈方

 岐真人传儿科

 秘法

 长沙张真人传治小儿

 感冒风寒方

 儿科

石室秘录·卷之六 数集

 伤寒门

 中寒门

 中暑门

 水湿门

 热症门

 燥症门

 内伤门

 血症

 腹痛

 喉痛

 气郁

 癫症

 狂症

 呆病

 厥症

 斑疹

 亡阳

 痢疾

 五绝

 砒毒

 虎伤

 烫火伤

 痈疽并无名疮毒

跋