2008年，编者们编辑出版了《北部湾海洋科学研究论文集》的第1辑，主要反映了2006年两个航次(特别是夏季航次)各专业的综合研究成果。今天与您见面的《北部湾海洋科学研究论文集》（作者林元烧、蔡立哲）的第3辑，则是海洋生物生态专业组老师和研究生们新的努力。论文的选题主要集中在2006—2007年四个航次在5个潜标站位和139个CTD站位上所获取的区域海洋学认识。为了增加对整个北部湾区域与长期背景的了解，论文集还征集了基于卫星遥感观测数据分析与基于数值模型数据再分析的研究论文。

北部湾叶绿素a含量的分布特征与季节变化

北部湾初级生产力的分布特征与粒级结构

北部湾异养细菌的水平分布特征及其影响因子

北部湾东侧海域桡足类种类组成及其时空分布

北部湾浮游端足类生态特征研究I：物种多样性

北部湾浮游端足类生态特征研究Ⅱ：群落结构

北部湾莹虾类生态学研究

北部湾毛颚类的生态特征研究

北部湾东侧海域海樽类时空分布及其与水团相关性研究

北部湾浮游幼虫(体)若干生态特征

北部湾北部海洋线虫的分布特征

北部湾底栖软体动物群落生态研究

北部湾底栖拖网甲壳动物与环境因子关系的研究

北部湾底拖网棘皮动物的种类组成与分布特征

北部湾底层鱼类的种类组成与分布生态

基于PSR模型的罗源湾生态系统健康评价

基于PSR模型的东山湾生态系统健康评价