《目录学发微古书通例》二书是余嘉锡在目录学领域的主要著作。余嘉锡先生认为目录学的根本意义在于“辨章学术，考镜源流”。在此思想指导下，《目录学发微》广泛利用中国历代学者在目录学方面的论著，对目录学的意义、功用和源流，对目录的体例和类例的沿革，都作了精辟论述。《古书通例》又名《古书校读法》，就汉魏之前的古书事出一般通例，以助读者阅读古书。

目录学发微

 目录学发微卷一

目录学之意义及其功用

目录释名

 目录学发微卷二

目录书体制一篇目

目录书体制二叙录

目录书体制三小序

目录书体制四板本序跋

 目录学发微卷三

目录学源流考上 周至三国

目录学源流考中晋至隋

目录学源流考下唐至清

 目录学发微卷四

目录类例之沿革

古今书目分部异同表

古书通例

 前言

 绪论

 卷一 案著录第一

诸史经籍志皆有不著录之书

古书不题撰人

古书书名之研究

汉志著录之书名异同及别本单行

 卷二 明体例第二

秦汉诸子即后世之文集

汉魏以后诸子

古书多造作故事

 卷三 论编次第三

古书单篇别行之例

叙刘向之校雠编次

古书之分内外篇

 卷四 辨附益第四

古书不皆手著