陈长林编著的《陈长林古琴谱集(二十世纪琴学萃编)》共分为三大部分：第一部分是一般介绍，包括前言、琴曲内容说明（包含104首曲目）和琴曲律制调弦（包含104首曲目）；第二部分精选琴谱88首；第三部分是附录、包括陈长林简历、音像及有关介绍报道和《闽江琴韵》介绍文章。最后附有后记。

第一部分 一般介绍／1

 一、前言／3

 二、琴曲内容说明／5

 三、琴曲律制调弦／14

第二部分 琴谱／17

 1．秋月照茅亭／19

 2．山中思友人／22

 3．黄云秋塞／24

 4．小胡笳／27

 5．泽畔吟／37

 6．楚歌／40

 7．华胥引／46

 8．离骚／49

 9．列子御风／56

 10．凌虚Ⅱ爪／61

 11．八极游／63

 12．飞鸣吟／67

 13．阳春／69

 14．短清／75

 15．神化引／81

 16．天风环佩／83

 17．白雪／86

 18．古风操／91

 19．忘机／95

 20．招隐／97

 21．获麟／100

 22．鹤鸣九皋／105

 23．潇湘水云／111

 24．乌夜啼／118

 25．大胡笳／125

 26．龙朔操／132

 27．广寒秋／139

 28．雉朝飞／142

 29．庄周梦蝶／150

 30．山居吟／156

 31．临邛引／159

 32．流觞／162

 33．仙佩迎风／167

 34．秋宵步月／169

 35．秋夜吟／173

 36．扊扅歌／175

 37．鹤舞洞天／179

 38．春晓吟／181

 39．孤馆遇神／183

 40．春思／189

 41．凤求凰／193

 42．定慧引／198

 43．关雎／200

 44．离骚／206

 45．修禊吟／215

 46．古怨／217

 47．开指黄莺吟／220

 48．文君操／221

 49．伯牙吊子期／223

 50．阳关三叠／225

 51．清江引／234

 52．秋江送别／235

 53．陋室铭／243

 54．胡笳十八拍／245

 55．孔圣经／267

 56．释谈章／272

 57．色空诀／279

 58．摩诃般若波罗蜜多心经／284

 59．四大景／288

 60．牧笛／291

 61．花宫梵韵／293

 62．渔樵问答／301

 63．那罗法曲／306

 64．渔歌／311

 65．庄周梦蝶／323

 66．风云际会／333

 67．鹧鸪天／340

 68．小普庵咒／342

 69．武陵春／344

 70．耕莘钓渭／346

 71．广陵散新谱／348

 72．天籁／353

 73．茉莉花／355

 74．洪湖水，浪打浪／359

 75．春江花月夜／363

 76．二泉映月／376

 77．化蝶／380

 78．钗头凤／384

 79．寒山僧踪／387

 80．六字吉祥颂／389

 81．楞严一笑／392

 82．阳关三叠／394

 83．平沙落雁／399

 84．易水慨古／404

 85．秋江夜泊／407

 86．潇湘水云／410

 87．欸乃／422

 88．古琴吟／429

第三部分 附录／431

 附录一 陈长林简历／433

 附录二 音像及有关介绍报道／434

 附录三 《闽江琴韵》介绍文章／439

后记／441