《医旨绪余》是明代医家孙一奎所撰的一部医论集。全书分上、下两卷。立论宗《内》、《难》，而参《易》（宋明理学），主要以脏腑、气血、经络、腧穴推明阴阳五行之理，对命门、相火的阐述，尤为详尽，首创“命门动气论”，又倡“不执方论”，并对《韩氏医通》的绪论、药性裁成，李东垣的药类法象，王好古的五脏苦欲补泻等诸家学说，作出了较为公正的评述。本医论集，值得一读。

卷上
太极图抄引
太极图
太极图说附：《中和集》太极图说
不知《易》者不足以言太医论
问三才所同者于人身何以见之
命门图说
右肾水火辩
七节之傍中有小心
《难经正义》三焦评附：东垣三焦论
问诊三焦包络
脉义
问十二支土多十二经火多之义
问手心主
手足经配合脏腑之义
问五行金木水火土之义
问心包络何以不得为脏
问右肾何以不得与十二经之数
问五行土无定体
问十二经脏腑命名之义
原呼吸
论诊法
证候推移指法
宗气营气卫气说
痢与滞下辩
噎膈翻胃辩
四时脉说
问伤寒桂枝汤用桂枝说
气郁胁痛论
论痰为津液脾湿所生
咳嗽
哮
喘
论汗不可纯作血看
论五郁
论呕血
论咳血
论齿衄
颤振
相火篇附：丹溪相火篇议
泄泻辩
防暑论
痿论
癫狂痫辩
鼻鼽
鼻渊
卷下
胁痛
腹中水块作痛
治肾消
罗太医药戒
人身经脉上下左右前后二十八脉考
人身有四海说
删定野山秘抄种子论
护胎说
王节斋《本草集要》参芪论
《洗冤录》载沿身骨节上下联络名目
《洗冤录》验胎法
人身内景说
不执方说
张、刘、李、朱、滑六名师小传
《医通》节文附：《医通》绪论章
药性裁成
《难经本义·十八难》图注解
《难经》肺金肝木浮沉说
《难经·七十五难》金不得平木"不"字辩
《难经·八十一难篇》"是病"二字辩
节抄《灵枢》引
本神篇
决气篇
胀论
五癃津液别篇
贼风篇
妇人无须篇
忧恚无言篇
邪客篇
大惑篇
十二经络脏象见证附：督任二脉起止
附：王好古类集五脏苦欲补泻药味
附：李东垣药类法象
攻克血积癥瘕及胎产解毒
十八反