高中生名侦探工藤新一被“黑衣组织”灌下了毒药后，变成了小孩子的模样。他隐藏真实身份，化名为江户川柯南，寄住在女朋友毛利兰的家里。
不知情的小兰，则是整天企盼着突然失踪的新一早日回来。
某日，小兰和柯南一行人来到一个以制作情人节巧克力闻名的山庄，可是他们竟然在这里遇上了奇特的谋杀案。虽然顺利地破案了，不过，眼看小兰拼命压抑内心寂寥的柯南，心中真是百感交集。
然后，他们竟然发现了一个写下“〇×△口”的死亡讯息的男性尸体。而且嫌犯的人数更是多达五十八个人……

FILE．1采收苹果的时刻
FILE．2反击的开端
FILE．3从天而降的邻居
FILE．4你到底是谁？
FILE．5暴风雨般的嘘声
FILE．6可疑的球迷
FILE．7冒牌球迷
FILE．8雨中的似曾相识
FILE．9湿毛巾的圈套
FILE．10拨云见日的记忆
FILE．11金苹果①