本书是专门记载炼丹药物的药学专著，外丹、医药并重，故名《丹药本草》。内容分为元素、氧化物、硫化物、氯化物、硫酸盐、碳酸盐、硅酸盐、非金属类，及其他化合物类等9类，包括无机药物62种，把能够炼制丹药的无机药物尽量收入，每一药物又分别名、来源、性味、成分、功能、主治等6个小节，下注“有名方剂”和“文献探索”，并编制了各家丹药处方（300余种）用途一览表。附收《海内孤本灵药秘方》一书，张觉人按为有清以来本丹药专书。

丹药本草
丹药本草钩元
元素类药物
水银
铅
金
银
铜
铁
锡
氧化物类药物
砒石
铅丹
无名异
伏龙肝
代赭石
磁石
石灰
白石英
紫石英
密陀僧
禹余粮
硫化物类药物
自然铜
丹砂
灵砂
铜矿石
雄黄
雌黄
礜石
氯化类药物
戎盐
卤碱
轻粉
粉霜
硇砂
绿盐
硫酸盐类药物
胆矾
石膏
朴硝
绿矾
黄矾
寒水石
白矾
玄精石
碳酸盐类药物
石钟乳
炉甘石
石青
……
硅酸盐类药物
非金属类药物
其他化合物类药物
各家丹药处方用途一览表
本书引用文献
丹药本草药物分类及符号表
海内孤本灵药秘方
方序
原序
海内孤本灵药秘方卷之上
海内孤本灵药秘方卷之下