本书分上下两篇，上篇为微生物技术基础，理论部分教学使用，包括项目一微生物的认知、项目二微生物的形态观察技术、项目三微生物的无菌技术、项目四微生物培养与控制技术、项目五微生物的代谢、项目六微生物的分离纯化与鉴定技术、项目七微生物菌种的选育、保藏与复壮技术、项目八微生物与农林、牧渔及食品；下篇为微生物技术实验实训，用于实训教学，根据教材新业态要求，该部分内容编写为活页式，共设计16个实训项目，涵盖授课专业实训，教师可以选择相关内容使用。
本书可作为应用型本科、高职、中职农业类专业基础课教材使用。