为评估国家重点生态功能区财政转移支付的生态环境保护效果，环保部、财政部于2009年启动了国家重点生态功能区县域生态环境质量考核评价工作。通过近三年的技术准备，目前已基本建立国家重点生态功能区县域生态环境质量考核的工作机制和技术体系，并于2012年研发了县级数据填报、省级数据审核以及国家数据分析评价及综合管理多层次多目标的软件系统，提高了该项工作的规范化、标准化、信息化和自动化水平。

罗毅、陈斌主编的《国家重点生态功能区县域生态环境质量考核工作手册》整理了国家重点生态功能区县域生态环境质量考核工作相关的文件、技术方案、技术指南以及软件使用手册，方便参与国家重点生态功能区县域生态环境质量考核工作的管理及技术人员使用。

第一篇 规章制度

第1章 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核办法

第2章 国家重点生态功能区转移支付办法

第3章 南水北调中线水源区县域生态环境质量考核有关要求

第4章 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核名单

第二篇 技术方法

第5章 2013年国家重点生态功能区县域生态环境质量考核工作实施方案

第6章 国家重点生态功能区县域生态环境指标监测技术方案

6.1 国家重点生态功能区县域监测点位布设技术要求

6.2 国家重点生态功能区县域地表水、空气质量监测断面（点位）及重点污染源名单

6.3 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核环境指标监测方案

6.4 国家重点生态功能区县域水质、空气质量及污染源评价方案

第7章 国家重点生态功能区县域生态环境质量数据技术审核指南

第8章 国家重点生态功能区县域生态环境质量现场核查技术指南

第三篇 数据填报与审核软件使用指南

第9章 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核数据填报规范

9.1 适用范围

9.2 填报内容

9.3 填报要求

第10章 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核省级数据审核软件用户使用手册

10.1 引言

10.2 系统运行环境

10.3 系统安装说明

10.4 系统主界面说明

10.5 系统功能操作说明

第11章 国家重点生态功能区县域生态环境质量考核县级数据填报软件使用手册

11.1 引言

11.2 系统运行环境

11.3 系统安装说明

11.4 系统主界面说明

11.5 系统功能操作说明