本书由北京大学医学部、卫生部北京医院、中国疾病预防控制中心、大连医科大学、中国科学院上海生命科学研究院、上海生物芯片国家工程研究中心、上海交通大学医学院附属瑞金医院和上海交通大学医学院从事医学微生物学相关专业的专家和研究人员编写完成，重点介绍基因组技术、转录组技术、蛋白质组技术、代谢组技术、基于基因组的病原体检测技术、微生物耐药基因研究等的发展和趋势，以及微生物学检测的自动化和未知病原的检测等。

第一章 病原微生物镜检技术

 第一节 普通光学显微镜

 第二节 几种特殊的光学显微镜

 第三节 电子显微镜

 第四节 运用显微镜进行活体动物体内成像技术

第二章 核酸体外扩增技术

 第一节 常规PCR

 第二节 反转录PCR

 第三节 定量PCR

 第四节 致突变PCR

 第五节 其他种类PCR

第三章 突变技术

 第一节 突变分析

 第二节 笔记标识突变

第四章 体内表达技术

 第一节 体内表达技术

 第二节 体内诱导的抗原技术

 第三节 差异荧光诱导(DFI)的启动子捕获技术

第五章 微生物基因组学技术

 第一节 微生物基因组测序

 第二节 基因组数据分析

 第三节 细菌比较基因组学

第六章 微生物蛋白质组技术

 第一节 蛋白质组技术简介

 第二节 蛋白质样品的制备和分离

 第三节 蛋白质鉴定技术

 第四节 定量蛋白质组技术

 第五节 免疫蛋白质组与生物信息学

 第六节 参考实验方案

第七章 微生物代谢组学

 第一节 微生物代谢组学概述

 第二节 代谢组学的应用

 第三节 代谢组学研究技术

 第四节 代谢组学研究展望

 第五节 参考实验方案

第八章 基因芯片在微生物基因组研究中的应用

 第一节 基因芯片概述

 第二节 基因芯片的原理

 第三节 基因芯片的制备方法

 第四节 基因芯片的检测技术

 第五节 基因芯片在微生物基因组研究中的应用

 第六节 微生物基因芯片应用展望

 第七节 参考实验方案

第九章 正常菌群分析技术

 第一节 DNA指纹图谱分析

 第二节 基因克隆文库分析

 第三节 分子杂交

 第四节 参考实验方案

第十章 微生物学检验的自动化

 第一节 法国生物梅里埃公司产品

 第二节 美国BD公司产品

 第三节 BioFosun微生物鉴定药敏分析系统

第十一章 微生物-宿主相互作用研究技术

 第一节 前言

 第二节 实验材料

 第三节 实验方法

 第四节 注意事项

第十二章 细菌对宿主细胞黏附和侵袭研究技术

 第一节 细菌的黏附

 第二节 细菌的侵入

 第三节 细菌在胞内的生存和繁殖

 第四节 宿主细胞反应

 第五节 参考实验方案

第十三章 抗原抗体检测技术

 第一节 基本原理

 第二节 技术应用

 第三节 统计学分析

 第四节 参考实验方案

第十四章 基于基因组的病原体检测分型技术

 第一节 基于基因组的病原体检测技术

 第二节 基于条带的病原体分型技术

 第三节 基于序列的病原体分型技术

 第四节 参考实验方案

第十五章 细菌对抗菌药物的敏感性试验

 第一节 微生物耐药性的概念与机制

 第二节 抗菌药物敏感性试验

 第三节 耐药性监测的分子生物学方法

 第四节 参考实验方案

第十六章 常用病毒培养技术

 第一节 实验动物

 第二节 鸡胚

 第三节 组织培养

 第四节 细胞克隆技术

 第五节 病毒蚀斑技术

第十七章 未知病原的检测

 第一节 疫情的发生与发展

 第二节 临床与实验室检查特征

 第三节 流行病学特征

 第四节 无形体感染的最终确定过程