冯全生主编的《瘟疫学(全国中医药行业高等教育十三五创新教材)》分为三部分：上篇概论，主要介绍瘟疫学的基本理论，包括瘟疫学的含义和特点、学术发展历程、相关概念和研究意义，以及瘟疫的病因和发病、辨证和防治等。中篇各论，分别对湿热疫、温热疫、暑热疫、寒疫和杂疫五大类瘟疫的概念、理论渊源、病因病机、诊断要点、辨证要点、常见证型、治法方药等进行介绍，并介绍十五个现代常见传染病的诊断要点及辨证治疗，部分病附有该病的诊疗指南或诊疗方案之中医药治疗。下篇为原文节选，遴选《温疫论》《伤寒瘟疫条辨》《疫疹一得》，以及《伤寒论》《伤寒总病论》《景岳全书》《温病条辨》《重订通俗伤寒论》《松峰说疫》《疫痧草》等著作中的代表性条文，释义阐述。此外，附篇选录了部分瘟疫医案和瘟疫防治方剂。总之，本教材在编写过程中，力图既重视对经典理论的传承，又突出临床的实用性，以期为现代传染性疾病的防治提供有价值的参考。

上篇 概论
第一章 绪论
第一节 瘟疫学的含义和特点
第二节 瘟疫学的形成与发展
第三节 瘟疫与相关概念辨
第四节 瘟疫学的研究意义
第二章 瘟疫的病因和发病
第一节 瘟疫的病因
第二节 瘟疫的发病
第三节 感邪途径
第三章 瘟疫的辨证
第一节 卫气营血辨证
第二节 三焦辨证
第三节 表里辨证
第四节 气血津液辨证
第五节 六经辨证
第四章 瘟疫的防治
第一节 瘟疫的预防
第二节 瘟疫的治疗
中篇 各论
第五章 湿热疫
第六章 温热疫
第七章 暑热疫
第八章 寒疫
第九章 杂疫
第十章 现代常见瘟疫辨治
下篇 原文节选
第十一章 湿热疫原文节选
吴又可《温疫论》节选
第十二章 温热疫原文节选
杨栗山《伤寒瘟疫条辨》节选
第十三章 暑热疫原文节选
余师愚《疫疹一得》节选
第十四章 寒疫原文节选
张仲景《伤寒论》节选
庞安时《伤寒总病论》节选
张景岳《景岳全书》节选
吴鞠通《温病条辨》节选
《重订通俗伤寒论》节选
第十五章 杂疫原文节选
刘松峰《松峰说疫》节选
陈耕道《疫痧草》节选
附篇1 瘟疫病案选录
附篇2 防治瘟疫方剂选