本书共分为6章。“第一章三亚珊瑚礁概况”，包括三亚的自然地理、社会经济、海洋环境以及自然保护区简况；“第二章三亚珊瑚礁生物多样性调查研究历史、内容与方法”，简单介绍了我国三亚海域造礁石珊瑚研究的历史背景和本次珊瑚礁生物多样性调查的内容和方法；“第三章三亚珊瑚礁的生物多样性”，主要描述本次珊瑚礁调查获得的现状信息，包括浮游动物、浮游植物、底栖生物（重点是造礁石珊瑚）和珊瑚礁鱼类，我国首次采用水下目测法进行了珊瑚礁鱼类调查；“第四章生物多样性热点分析”，主要结合历史资料进行生物多样性的热点及其变化分析；“第五章三亚珊瑚礁存在的问题与对策”，主要根据生物多样性调查反映的信息以及对主要利益相关者的知识和认知情况调查所反映的问题提出对策与建议；“第六章三亚珊瑚礁自然保护区珊瑚礁监测与管理”，介绍了一套简易的生物多样性长期监测规程以及数据库与GIS管理平台和方案；本书附录提供了三亚珊瑚礁浮游动植物、造礁石珊瑚和珊瑚礁鱼类的种名录与地理分布。

第一章 三亚珊瑚礁概况

 第一节 自然地理概况

 第二节 社会经济概况

 第三节 三亚珊瑚礁国家级自然保护区简况

 第四节 三亚珊瑚礁海洋环境概况

第二章 三亚珊瑚礁生物多样性调查研究历史、内容与方法

 第一节 我国三亚海域造礁石珊瑚研究的历史背景

 第二节 2006年三亚珊瑚礁生物多样性的现状调查

第三章 三亚珊瑚礁的生物多样性

 第一节 珊瑚礁生物多样性现状信息

 第二节 其他礁栖生物的多样性

 第三节 生物多样性现状小结

第四章 生物多样性热点分析

 第一节 生物多样性热点的现状

 第二节 生物多样性热点的变化

第五章 三亚珊瑚礁存在的问题与对策

 第一节 生物多样性现状信息反映的问题

 第二节 生物多样性现状调查主要结果与局限性

 第三节 三亚珊瑚礁区主要利益相关者的知识和认知水平改变情况的调查

第六章 三亚珊瑚礁自然保护区珊瑚礁监测与管理

 第一节 三亚珊瑚礁自然保护区生物多样性长期监测简易规程与方案

 第二节 三亚珊瑚礁地理信息系统（GIS）与数据库建设

附录

 附录1 2006年三亚现状调查造礁石珊瑚详细的种类和站位分布

 附录2 2006年三亚现状调查浮游植物种类和站位分布

 附录3 2006年三亚现状调查浮游动物种类和站位分布

 附录4 2006年三亚现状调查珊瑚礁鱼类种类和站位分布

 附录5 三亚国家级珊瑚礁自然保护区调查问卷

参考文献